ห้องขังรวม และจุดเฝ้าสังเกตการณ์กลาง

อาคารเรือนจำเป็นอาคารไม้ชั้นเดียวจำนวนห้าหลัง แผ่ออกไปรอบอาคารเฝ้าระวังกลาง และเชื่อมต่อกันด้วยทางเดินที่มีหลังคาคลุม จึงเรียกรูปแบบนี้ว่า อาคารเรือนจำแบบห้าแฉก ผนังภายนอกกรุด้วยไม้ซ้อนเกล็ด เดิมหลังคามุงด้วยกระเบื้องซังงาวาระ แต่ภายหลังได้เปลี่ยนเป็นมุงด้วยแผ่นเหล็ก

อาคารเรือนจำถูกกำหนดหมายเลขจากทิศเหนือไปทิศใต้ โดยอาคารหมายเลข 1 หมายเลข 3 และหมายเลข 5 มีความยาวตามแนวสันหลังคา 58.2 เมตร ส่วนอาคารหมายเลข 2 และหมายเลข 4 มีความยาว 72.7 เมตร ภายในอาคารแต่ละหลังมีทางเดินกลาง และห้องขังจัดเรียงอยู่ทั้งสองด้าน อาคารหมายเลข 4 มีห้องขังเดี่ยวจำนวน 80 ห้อง และอาคารหมายเลข 5 มีห้องขังเดี่ยวจำนวน 20 ห้อง โดยแต่ละห้องมีพื้นที่ประมาณ 5 ตารางเมตร ห้องที่เหลือเป็นห้องขังรวม มีพื้นที่ประมาณ 10 ตารางเมตร รวมจำนวนห้องขังทั้งหมด 226 ห้อง

อาคารหมายเลข 1 หมายเลข 3 และหมายเลข 5 มีช่องแสงติดตั้งกระจกหนา 7 มิลลิเมตรจำนวนสองตำแหน่ง ส่วนอาคารหมายเลข 2 และหมายเลข 4 มีช่องแสงจำนวนสามตำแหน่ง เพื่อป้องกันการทำลายกำแพง เสาภายในผนังถูกจัดวางอย่างหนาแน่น โดยห้องขังรวมมีระยะห่างของเสาประมาณ 30 เซนติเมตร และห้องขังเดี่ยวมีระยะห่างประมาณ 21 เซนติเมตร

โครงสร้างหลังคาใช้โครงถักแบบควีนโพสต์ โดยเชื่อมคานล่างเข้าด้วยกันด้วยเหล็กเสริม และที่กึ่งกลางจะเห็นปลายเหล็กเสริมในลักษณะรูปตัว Y กลับหัว พื้นทางเดินปูด้วยอิฐ ส่วนพื้นห้องขังปูด้วยไม้กระดาน ภายในแต่ละห้องมีห้องสุขาอยู่ที่มุมหนึ่ง ผนังภายในกรุไม้ระแนงและฉาบปูน เพดานเป็นเพดานเรียบกรุด้วยแผ่นไม้ขัดเรียบหนา 15 มิลลิเมตร

ผนังระหว่างทางเดินกับห้องขังมีประตูไม้ติดตั้งอยู่ตรงกลาง มีแผงลูกกรงแนวตั้งอยู่ทั้งสองด้าน และมีหน้าต่างกรงเหล็กอยู่ด้านบน หน้าตัดของลูกกรงมีลักษณะเป็นรูปสี่เหลี่ยมด้านขนานหรือรูปงอคล้ายตัวอักษร เพื่อป้องกันไม่ให้ผู้ต้องขังมองเห็นกันข้ามทางเดิน ประตูไม้เป็นบานเปิดด้านเดียว มีแม่กุญแจเหล็กขนาดใหญ่ ช่องมองด้านบน และช่องส่งอาหารด้านล่าง ภายในห้องขังมีหน้าต่างกระจกบานเลื่อนสองชั้นพร้อมช่องแสงเหนือหน้าต่างสูงจากพื้นประมาณ 1.5 เมตร และมีเหล็กดัดติดตั้งอยู่ด้านนอก

อาคารเฝ้าระวังกลางมีป้อมยามรูปแปดเหลี่ยมอยู่ตรงกลาง ซึ่งสามารถมองเห็นทางเดินที่เชื่อมไปยังอาคารเรือนจำแต่ละหลังได้ทั้งหมด

ตั้งแต่วันที่ 24 มิถุนายน 2025 เป็นต้นไปมีการดำเนินงานปรับปรุงความทนทานต่อแผ่นดินไหวและบูรณะอนุรักษ์เพื่อการคงสภาพของโบราณสถานสำคัญ (Important Cultural Property) ในเรือนจำแบบห้าปีกโดยดำเนินการในเรือนจำปีกที่ 1 และปีกที่ 3 ระหว่างช่วงเวลาดำเนินงาน จะไม่สามารถเข้าชมเรือนจำปีกดังกล่าวได้ อย่างไรก็ตาม รือนจำปีกที่ 2 ปีกที่ 4 และปีกที่ 5 ยังคงเปิดให้เข้าชมได้ตามปกติ