獨立型單人牢房

單人牢房是以《監獄法》中「一囚一房」為理想原則所設計的制度。網走分監創設時設有16間單人牢房，於明治45年（1912年）火災後重建時則增至34間。然而，隨著行刑目的逐漸轉向促進受刑人回歸社會，加上認為雜居生活有助於培養社會性，以及單人牢房在管理上相當耗費人力，因此其使用逐步減少。

博物館內的單人牢房是依據當時留下的資料復原而成，為一座木造、瓦葺屋頂的小屋。室內分為土間與起居室兩個空間，起居室面積約為兩張榻榻米大小的木地板，僅能從入口與花板處微微引入自然光。